Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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