Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACC2-203ENST00000358010 3815 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DKK2-201ENST00000285311 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPECC1-201ENST00000261503 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 L3MBTL3-202ENST00000368136 4235 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590491.1-201ENST00000611916 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNA2-211ENST00000639233 5256 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPM1K-210ENST00000608933 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT18P59-202ENST00000534728 3338 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ECE2-204ENST00000402825 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC037441.1-202ENST00000511897 3879 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCAR1-201ENST00000432564 4768 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL22RA1-201ENST00000270800 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTBP-201ENST00000305949 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A13-201ENST00000339556 514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF70P1-201ENST00000417480 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365356.2-201ENST00000441526 196 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355537.1-201ENST00000446589 450 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073465.3-201ENST00000448468 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL683842.1-201ENST00000455505 525 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018450.2-201ENST00000492307 368 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPARP-AS1-203ENST00000494270 711 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC146949.1-201ENST00000505946 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC146944.1-201ENST00000508439 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL711P-201ENST00000579731 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms