Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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