Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms