Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SEC23BQ15437 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms