Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BRD3Q15059 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms