Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ODF1Q14990 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms