Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms