Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms