Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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