Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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ATP1A4Q13733 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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ATP1A4Q13733 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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