Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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PKD2Q13563 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PKD2Q13563 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
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