Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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