Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PRDM2Q13029 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms