Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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RNF20Q5VTR2 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RNF20Q5VTR2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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