Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPROQ16827 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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