Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA9Q13797 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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