Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
AP3B2Q13367 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms