Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NFIAQ12857 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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