Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
CACNB1Q02641 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms