Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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