Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SOBPA7XYQ1 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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