Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
FHL3Q13643 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms