Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPN13Q12923 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPN13Q12923 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN13Q12923 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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