Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms