Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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