Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCIRG1Q13488 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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