Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1Q9UJ41 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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