Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms