Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP3Q9Y6F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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