Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUBP2Q9Y5Y2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUBP2Q9Y5Y2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUBP2Q9Y5Y2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUBP2Q9Y5Y2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUBP2Q9Y5Y2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms