Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP16Q9Y5T5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP16Q9Y5T5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms