Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms