Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC5Q9UQL6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms