Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms