Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX6Q9UNH7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms