Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN1Q9ULB1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN1Q9ULB1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
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