Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA3Q9UL41 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms