Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP3Q9UKI2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms