Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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