Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms