Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPC1L1Q9UHC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms