Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MLH3Q9UHC1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MLH3Q9UHC1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms