Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRP68Q9UHB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP68Q9UHB9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms