Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIN1Q9NXP7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIN1Q9NXP7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms