Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT57Q9NWB7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT57Q9NWB7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms