Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms