Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINM1Q9NU53 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms