Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECHDC1Q9NTX5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms