Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX15Q9NRS6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms